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約28ヘクタールの自然観察の森の中に、センター本館と観察棟が建てられている。
本館には福井の自然をわかりやすく展示した展示ホールを始め、レクチャーホールや資料室などがある。観察棟のほうには、1階に40人ほど収容可能なプラネタリウム室、2階に野外観察室があるほか、3階には口径80ｃｍの反射望遠鏡を備えた天体観察室があります。